В 2006 году в стране начал действие национальный проект по иммунизации населения против гриппа. Новочебоксарску было выделено 16 800 доз вакцины против гриппа: работникам медицины, образования, детям до 4 класса и пенсионерам. В рамках национального проекта вакцина использована полностью.

Всего должно было быть привито 21 % населения Новочебоксарска. Для чего дополнительно было  выделено 340 тысяч рублей (за счет фонда предупредительных мероприятий территориального фонда ОМС) на вакцинацию детей с 8 по 10 класс, работников промышленных предприятий.

На сегодняшний день 42 %  новочебоксарских детей иммунизировано от гриппа. По предприятиям и организациям города привито 11255 человек. Всего в городе иммунизировано 27,6 % взрослого населения, что на 4,5 % меньше, чем в прошлом году. Объясняется это тем, что в октябре федеральные аптечные склады работали только на национальный проект. Только с 10 ноября началась коммерческая реализация вакцины.